Entradas

Renombrar de forma masiva ficheros en Python y wxPython

Imagen
 En este post se presenta renombra v1.0 . Una aplicación gráfica escrita en Python y wxPython para renombrar ficheros, de forma masiva.  En concreto: ➔ Permite seleccionar carpetas (directorios), y visualiza los ficheros y directorios que contiene, con iconos identificativos. ➔ Permite renombrar aquellos ficheros de ese directorio que tengan una extensión específica. ➔ El nombre de los nuevos ficheros tendrán un sufijo (que será un número secuencial a partir de uno dado), y opcionalmente podrán tener un prefijo. Se puede descargar el código de GitHub:  https://github.com/angeloide78/renombra Seleccionamos el directorio: Vamos a renombrar de forma masiva todos los ficheros, renombrando con un sufijo a partir de 10, y un prefijo "imagen": Hacemos click en el botón "Renombrar", y tenemos... Esta aplicación tiene multitud de mejoras... te animo a que te descargues el programa, veas como se hace, ... mejóralo...  salu2.

Instalar wxPython y wxFormBuilder en Linux

Imagen
Pasos a seguir para instalar el framework gráfico wxPython en Linux (en distribuciones basadas en Debian, como Ubuntu, Zorin, Mint, etc)  y con Python3 como intérprete del lenguaje . Abrimos un terminal de Linux y ejecutamos secuencialmente las siguientes instrucciones o comandos: sudo apt update sudo apt install python3-pip pip3 install attrdict sudo apt-get install libgtk-3-dev pip3 install wxPython Para probar si efectivamente se ha instalado la última versión (a día de hoy la 4.2.0 Fénix), podemos verlo en el propio intérprete: Instalar wxFormBuilder es más sencillo. Únicamente hay que ir al repositorio de GitHub , en: https://github.com/wxFormBuilder/wxFormBuilder/releases Y elegir la última versión... Salvo que estés interesado o interesada en bajarte el código y compilarlo tu mismo o misma... te sugiero que bajes el paquete DEB ... Una vez instalado debes ver algo como esto: salu2.

Python y Oracle

Se puede acceder desde Python a Oracle de manera muy sencilla. En este post se presenta una mini receta de como conseguir este propósito. Este caso se va a ver para el entorno Microsoft Windows . Se descarga Python 2.7 64 bit para Windows , desde https://www.python.org/download/releases/2.7/ , mediante el recurso https://www.python.org/ftp/python/2.7/python-2.7.amd64.msi . Se descarga el módulo de conexión de Python a Oracle , desde https://pypi.python.org/pypi/cx_Oracle/5.2 , mediante el recurso https://pypi.python.org/packages/2.7/c/cx_Oracle/cx_Oracle-5.2-11g.win-amd64-py2.7.exe#md5=e606259cfe6733e9f941ab2251c1f0bd Una vez instalado Python (64 bit) y cx_Oracle (64 bit), se prueba: C:\Users\Ángel> python Python 2.7 (r27:82525, Jul  4 2010, 07:43:08) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)] on win32 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information. >>> import cx_Oracle >>> db = cx_Oracle.connect

Generación de árboles filogenéticos UPGMA a partir de un código de proteína, en Python

Imagen
En este post se presenta una aplicación para la generación de árboles filogenéticos UPGMA a partir de un código de proteína en formato FASTA . La aplicación se puede descargar de: https://sites.google.com/site/elviajedelnavegante/codigo/FILO_TREE.zip?attredirects=0&d=1 Los árboles filogenéticos son útiles para encontrar los familiares más cercanos a nuestro organismo de estudio. Se ha implementado mediante la creación de un script Python , que utiliza la biblioteca externa BioPython para la creación de árboles filogenéticos. La aplicación permite obtener secuencias similares a partir de una secuencia de proteína dada. Estas secuencias obtenidas por Blast son procesadas con un algoritmo de alineamiento múltiple ( Clustal ), cuyo resultado sirve para crear la matriz de distancias y el árbol filogenético UPGMA. La aplicación es multiplataforma, para sistemas Microsoft Windows y Linux . La configuración permite seleccionar cuántas secuencias como máximo se quiere u

Script para calcular tamaño de ficheros pasados como parámetros

Hola. En este post presento un script muy sencillo para calcular el total del tamaño de los ficheros pasados como parámetros. Se hace uso del módulo os para tratamiento de ficheros. # -*- coding: utf-8 -*- #------------------------------------------------------------------------------- # Name: sizefiles.py # Purpose: # # Author: Ángel luis # # Created: 10-04-2015 # Copyright: (c) Ángel 2015 # Licence: GPL 3 #------------------------------------------------------------------------------- import os import sys def main(): # Get files. if len(sys.argv) == 0: raw_input('I need some file names. Press any key...') else: # Arguments. files = [i for i in sys.argv] try: total_size = 0 for i in files[1:]: total_size += os.path.getsize(os.path.realpath(i)) raw_input("Total size: %d bytes. Press any key..." % total_size) except: raw_input("Files exist

Compilar Tinker Molecular Modeling en Linux

Imagen
Hola. En este post vamos a ver como compilar el software de modelización molecular Tinker . Lo primero es descargarse el código fuente, que se puede encontrar en: http://dasher.wustl.edu/tinker/ Instalamos la aplicación en Linux normalmente. Para compilar Tinker podemos utilizar el compilador Fortran G95 , que se obtiene de: http://www.g95.org/downloads.shtml Una vez descargado Fortran , se instala normalmente (es un paquete DEB). Una vez instalado Tinker y el compilador Fortran G95 , los pasos a seguir son los siguientes: 1) Nos vamos a la carpeta MolecularTools , que es donde está instalado Tinker. 2) En MolecularTools/tinker/linux/gfortran tenemos los ficheros make para compilar la aplicación. A estos ficheros les damos permisos de ejecución. He hecho chmod 777 sobre todos ellos. 3) Estos ficheros ( compile.make, library.make, link.make, rename.make ) se copian al directorio MolecularTools/tinker/linux/source. 4)  Nos vamos a este directorio do

Compilando DB Browser for SQLite 3.5.1

Imagen
Para sistemas Linux hay una forma muy fácil de compilar DB Browser for SQLite . Esta herramienta es muy útil para trabajar con bases de datos SQLite , siendo multiplataforma (Linux, Mac y Windows) y Open Source. La última versión a fecha de hoy, es la 3.5.1. Paso 1 : Bajarse el código fuente de su página web: http://sqlitebrowser.org/ La última versión: https://github.com/sqlitebrowser/sqlitebrowser/zipball/master Paso 2 : Instalarse los paquetes libqt4-dev y libsqlite3-dev . Paso 3 : Desempaquetar (o descomprimir) el código fuente. Ir a la carpeta sqlitebrowser-3.5.1 , y ejecutar:   cmake . A continuación ejecutar: make Si todo ha ido bien debe de empezar a aparecer algo como esto: El resultado es un fichero compilado, llamado sqlitebrowser , de manera que lo ejecutamos: ./sqlitebrowser Abriéndose la aplicación: Saludos.